微波在臨床醫學上的應用主要集中在微波手術及微波理療兩大方面。

微波是一種高頻電磁波，伴隨著微波的傳送，電能轉換為微波能量進行傳送。

根據微波源的情況來劃分，微波源經過了磁控管、晶體管（固態源）、集成電路（即固態模塊）。常見的微波治療儀器主要采用的磁控管微波治療儀器。這類儀器受微波發生器件的限制，其頻率基本上都是2450MHz，需要一千多伏的高壓才能正常工作。儀器功耗較大。在臨床實踐中發現，微波頻率越高，其對肌體的熱穿透深度越小。因此，磁控管微波治療儀器主要用在手術治療儀器上或淺表治療方面。

固態模塊具有頻率穩定性高，在安全電壓下工作，功耗低，使用壽命長。更主要的特點是選用微波頻率為433MHz，穿透深度大，加溫均勻。在體表就能夠對多種深部組織的疾病進行有效治療。

在此基礎上，將脈沖調制技術應用到微波治療儀上，進一步發揮了微波治療的優點，克服了常規的微波連續輸出的模式，使用連續波治療時體表溫度高于治療部位的溫度，脈沖波則反之。所謂脈沖調制技術，即在治療過程中，微波的輸出可以根據不同的部位以及不同的病例進行脈沖頻率選擇，找出一種最佳的微波輸出模式。